Doctorado Química

Programa Conjunto entre Universidad de Valparaíso y Universidad Técnica Federico Santa María

 

Grado: Doctor en Ciencias, mención Química
Régimen: Diurno – Tiempo completo
Duración: 4 años

Programa Acreditado 4 años, hasta agosto de 2021. Comisión Nacional de Acreditación. 

 

Organizado por:

Claudio Morgado

Área principal:

Estudio computacional de la estructura, dinámica, y termodinámica de ácidos nucleicos y complejos supramoleculares

Universidad: Universidad Técnica Federico Santa María
Profesor: Colaborador
E-mail: claudio.morgado@usm.cl
Año en que se integró al programa:
Dedicación Estimada:
Grado Máximo:

Ph.D en Química Computacional / Universidad de Manchester, Inglaterra

Año de graduación: 2007

Claudio Morgado Espinoza tiene un Ph.D en Química Computacional de la Universidad de Manchester.

Publicaciones indexadas en los últimos 10 años:

Ver más
  1. Conformation change of opiorphin derivates. A theoretical study of the radical initiated epimerization of opiorphin. János J. Szórád, Eszter P. Faragó, Anita Rágyanszki, Franco A. Cimino, Béla Fiser, Michael C. Owen, Balázs Jójárt, Claudio A. Morgado, Milán Szőri, Svend J. Knak Jensen, Imre G. Csizmadia, and Béla Viskolcz. Phys. Lett., 2015, 3, 626.
  2. Understanding the role of base stacking in nucleic acids. MD and QM analysis of tandem GA base pairs in RNA duplexes. Claudio A. Morgado, Daniel Svozil , Douglas H. Turner and Jiří Šponer. Chem. Chem. Phys., 2012, 14, 12580.
  3. Comment on «Computational Model for Predicting Experimental RNA and DNA Nearest-Neighbor Free Energy Rankings». Jiří Šponer, Claudio A. Morgado and Daniel Svozil. J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 8331.
  4. Reference MP2/CBS and CCSD(T) quantum-chemical calculations on stacked adenine dimers. Comparison with DFT-D, MP2.5, SCS(MI)-MP2, M06-2X, CBS(SCS-D) and force field descriptions. Claudio A. Morgado, Petr Jurečka, Daniel Svozil, Pavel Hobza and Jiří Š Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 14, 3522.
  5. Balance of attraction and repulsion in nucleic-acid base stacking: CCSD(T)/Complete-Basis-Set-limit calculations on uracil dimer and a comparison with the force-field description. Claudio A. Morgado, Petr Jurečka, Daniel Svozil, Pavel Hobza and Jiří Šponer. J. Chem. Theory Comp. 2009, 5, 1524.
  6. A QM/MM study of fluoro-aromatic interactions at the binding site of Carbonic Anhydrase II, using a DFT method corrected for dispersive interactions. Claudio A. Morgado, Ian H. Hillier, Neil A. Burton and Joseph J. W. McDouall. Chem. Chem. Phys.2008, 10, 2706.
  7. The interaction of carbohydrates and amino acids with aromatic systems studied by density functional and semi-empirical molecular orbital calculations with dispersion corrections. Raman Sharma, Jonathan P. McNamara, Rajesh K. Raju, Mark A. Vincent, Ian H. Hillier and Claudio A. Morgado. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 2767.
  8. The non-covalent functionalisation of carbon nanotubes studied by density functional and semi-empirical molecular orbital methods including dispersion corrections. Jonathan P. McNamara, Raman Sharma, Mark A. Vincent, Ian H. Hillier and Claudio A. Morgado. Chem. Chem. Phys.2008, 10,128.
  9. The structure and binding energies of the van der Waals complexes of Ar and N2 with phenol and its cation, studied by high level ab initio and density functional theory calculations. Mark A. Vincent, Ian H. Hillier, Claudio A. Morgado, Neil A. Burton and Xiao Shan. Chem. Phys.2008, 128, 044313.
  10. Density functional and semiempirical molecular orbital methods including dispersion corrections for the accurate description of noncovalent interactions involving sulphur-containing molecules. Claudio A. Morgado, Jonathan P. McNamara, Ian H. Hillier, Neil A. Burton and Mark A. Vincent. Chem. Theory Comp.2007, 3, 1656.
  11. Can the DFT-D method describe the full range of noncovalent interactions found in large biomolecules? Claudio A. Morgado, Mark A. Vincent, Ian H. Hillier and Xiao Shan. Chem. Chem. Phys.2007, 9, 448.
  12. Can the semiempirical PM3 scheme describe iron-containing bioinorganic molecules? Jonathan P. McNamara, Mahesh Sundararajan, Ian H. Hillier, Jun Ge, Andrew Campbell and Claudio A. Morgado. Comput. Chem. 2006, 27, 1307.

Proyectos de investigación en los últimos 10 años:

  1. Proyecto Quimal 2013 (CONICYT): “High Performance Computing System for the Theoretical Search of Molecular Species in Astronomical Environments.” (3 años)
  2. Proyecto USM 2013: “Cálculo Teórico Sistemático de Propiedades Termodinámicas de Compuestos Orgánicos.” (2 años)
  3. Proyecto USM 2011: “Estudio computacional de la estructura y dinámica de la primera capa de solvatación de bucles internos de ARN que exhiben apareamientos GA.” (2 años)
  4. Proyecto Fondecyt de Iniciación 2010: “Predicción teórica del efecto de las basesflanqueantes en la estructura y dinámica de bucles internos de ARN que exhiben apareamientos GA o GU. Análisis del rol jugado por las interacciones de apilamiento en la preferencia conformacional de los bucles internos.” (2 años)